Геологічний музей був заснований ще у 1834 р. як Мінералогічний кабінет кафедри мінералогії та геогнозії Університету Св. Володимира.
У вітринах палеонтологічного відділу представлені всі відомі рештки організмів, які населяли прадавні моря і сушу нашої Землі.
Є в музеї і невеличка експозиція, присвячена геологічній історії Антарктиди і Українській антарктичній станції «Академік Вернадський».